La Fundació Reina Sofia va ser constituïda el 1977 amb un petit capital aportat personalment per Sa Majestat la Reina. És una fundació mixta de caràcter benèfic i cultural, sense ànim de lucre i de naturalesa permanent. Des de 1994 gestiona i promou nombrosos projectes educatius i sanitaris, així com d'ajuda social i humanitària, dels quals s'han beneficiat nens, adults, immigrants, discapacitats i afectats per catàstrofes naturals. 

Sa Majestat la Reina és la presidenta executiva de la Junta del Patronat de la Fundació, que està constituïda per un mínim de sis vocals i un màxim de deu, entre els quals es nomena un comitè executiu els membres del qual pertanyen al personal que treballa al palau de La Zarzuela.

De 2002 a 2007 una de les principals línies d'actuació de la Fundació Reina Sofia ha estat el Proyecto Alzheimer, que ara per ara té com a principal exponent el Centre Alzheimer de la Fundació Reina Sofia, inaugurat el 2007 a Vallecas, on fins ara s'han dut a terme 27 projectes de recerca, sis dels quals d'àmbit internacional. També ha generat més de 60 publicacions científiques i 38 comunicacions a congressos i reunions científiques.

Actualment s'està duent a terme un projecte de recerca de diagnòstic precoç, Projecte Vallecas, que està dotat amb 1.800.000 euros i disposa de l'ajuda de 1.000 voluntaris. Així mateix, s'ha creat una unitat d'orientació diagnòstica que ajudarà a la recerca d'aquesta malaltia i servirà per diagnosticar-la.

El Centre Alzheimer de la Fundació Reina Sofia està gestionat per la Comunitat de Madrid, en la part assistencial, i per la Fundació Centre de Recerca de Malalties Neurològiques (CIEN), en la part de recerca. Està format per una residència en règim d'internat per a 156 malalts d'Alzheimer, un centre de dia en règim ambulatori per a 40 malalts, una unitat de recerca sobre la malaltia i un centre de formació sobre la malaltia per al personal sanitari, els familiars i els voluntaris.